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天津工業(yè)生物所在優(yōu)化糖基化酶堿基編輯器方面取得新進(jìn)展
來源：天津工業(yè)生物所
山東拓普生物工程有限公司  http://www.jlkcpj.cn
GBE編輯器可實(shí)現(xiàn)堿基C-to-G的編輯，但其仍存在堿基編輯效率偏低、靶向位點(diǎn)范圍受限等問題，這大大限制了GBE堿基編輯器的應(yīng)用。因此，亟需對現(xiàn)有糖基化酶堿基編輯器進(jìn)行優(yōu)化，開發(fā)出堿基編輯效率高、靶向位點(diǎn)范圍廣的GBE突變體。
近日，中國科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所畢昌昊研究員帶領(lǐng)的合成生物技術(shù)研究團(tuán)隊(duì)、張學(xué)禮研究員帶領(lǐng)的微生物代謝工程團(tuán)隊(duì)在優(yōu)化糖基化酶堿基編輯器方面取得新進(jìn)展。為了提高GBE堿基編輯器的編輯效率，研究團(tuán)隊(duì)首先將轉(zhuǎn)錄激活因子VP64融合表達(dá)在GBE編輯器脫氨酶的氨基端（Vp64-APOBEC-nCas9-UNG），結(jié)果表明Vp64-APOBEC-nCas9-UNG的C-to-G編輯效率比GBE有顯著提高。為了進(jìn)一步擴(kuò)大APOBEC-nCas9-UNG的應(yīng)用范圍，研究團(tuán)隊(duì)分別融合表達(dá)了SunTag系統(tǒng)與SpRY-Cas9，構(gòu)建了SunTag-GBEs和SpRY-GBEs。與GBE相比，SunTag-GBEs在哺乳動物細(xì)胞中的編輯效率、編輯純度和編輯框都出現(xiàn)了顯著提升。同時(shí)SpRY-GBEs克服PAM序列的限制，實(shí)現(xiàn)了對靶向位點(diǎn)范圍的拓展。該研究通過不同策略對GBE進(jìn)行優(yōu)化，獲得性能更為優(yōu)越的GBE突變體。
該研究工作得到國家自然科學(xué)基金、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、天津市合成生物技術(shù)創(chuàng)新能力提升行動和中國博士后科學(xué)基金的資助，相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于Cell Reports期刊。天津工業(yè)生物所客座碩士研究生董興嘯和博士后楊超是該論文的共同第一作者，大連工業(yè)大學(xué)的陳明教授、天津工業(yè)生物所張學(xué)禮研究員和畢昌昊研究員為該論文的共同通訊作者。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111090