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最新研究揭示忍冬亞屬深層演化關(guān)系
[所屬分類:行業(yè)動態(tài)] [發(fā)布時間:2023-5-10] [發(fā)布人:網(wǎng)站管理員2] [閱讀次數(shù):] [返回]
最新研究揭示忍冬亞屬深層演化關(guān)系
作者:劉如楠 來源:中國科學(xué)報
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jlkcpj.cn
5月6日,海南大學(xué)三亞南繁研究院教授王華鋒課題組在《分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育》在線發(fā)表文章,該研究通過雜交富集測序數(shù)據(jù)揭示了忍冬亞屬(Chamaecerasus)內(nèi)的深層系統(tǒng)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)了忍冬亞屬原產(chǎn)東亞和中亞,空枝組和忍冬組起源東亞,隨后擴(kuò)散到其他地區(qū),亞洲內(nèi)陸干旱化可能促進(jìn)該地區(qū)空枝組和忍冬組快速輻射演化。
研究人員對37份忍冬屬植物進(jìn)行了取樣,包括忍冬亞屬的4個組和6個外類群,利用雜交富集和淺層基因組測序產(chǎn)生的和核基因數(shù)據(jù)和葉綠體數(shù)據(jù),構(gòu)建忍冬屬系統(tǒng)發(fā)育樹,包括核基因串聯(lián)樹、核基因物種樹和葉綠體全基因樹,發(fā)現(xiàn)忍冬亞屬內(nèi)存在廣泛的核質(zhì)不一致,核基因和葉綠體系統(tǒng)發(fā)育分析都支持忍冬亞屬與輪花亞屬為姊妹類群。在忍冬亞屬中,支持直管組和空枝組的單系性,而囊管組和忍冬組為多系。
根據(jù)核基因和葉綠體的系統(tǒng)關(guān)系,研究人員建議將藍(lán)葉忍冬Lonicera korolkowii歸并到空枝組,將藍(lán)果忍冬Lonicera caerulea歸并到忍冬組。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn),忍冬屬植物估計起源于漸新世中期(26.45 Ma)。忍冬組的干群年齡為17.09 Ma(95%HPD:13.30-24.45)。輪花亞屬干群年齡估計為16.35 Ma(95%HPD:14.12-23.66)。祖先分布區(qū)重建表明忍冬亞屬原產(chǎn)東亞和中亞,空枝組和忍冬組起源東亞,隨后擴(kuò)散到其他地區(qū),亞洲內(nèi)陸干旱化可能促進(jìn)該地區(qū)空枝組和忍冬組快速輻射演化。
本文的第一作者、海南大學(xué)博士生孫慶惠表示,該研究完全支持白令海峽和北大西洋陸橋關(guān)于北半球洲際遷移的假說?偟膩碚f,這一工作較好地解決了忍冬亞屬內(nèi)主要分支之間的深層系統(tǒng)關(guān)系,特別是忍冬亞屬內(nèi)目前公認(rèn)的四個組間的關(guān)系,也為忍冬亞屬的分類復(fù)雜分支和物種形成提供新見解。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107808
(本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò),版權(quán)歸原作者所有,如有侵權(quán)可后臺聯(lián)系刪除。)
作者:劉如楠 來源:中國科學(xué)報
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jlkcpj.cn
5月6日,海南大學(xué)三亞南繁研究院教授王華鋒課題組在《分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育》在線發(fā)表文章,該研究通過雜交富集測序數(shù)據(jù)揭示了忍冬亞屬(Chamaecerasus)內(nèi)的深層系統(tǒng)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)了忍冬亞屬原產(chǎn)東亞和中亞,空枝組和忍冬組起源東亞,隨后擴(kuò)散到其他地區(qū),亞洲內(nèi)陸干旱化可能促進(jìn)該地區(qū)空枝組和忍冬組快速輻射演化。
研究人員對37份忍冬屬植物進(jìn)行了取樣,包括忍冬亞屬的4個組和6個外類群,利用雜交富集和淺層基因組測序產(chǎn)生的和核基因數(shù)據(jù)和葉綠體數(shù)據(jù),構(gòu)建忍冬屬系統(tǒng)發(fā)育樹,包括核基因串聯(lián)樹、核基因物種樹和葉綠體全基因樹,發(fā)現(xiàn)忍冬亞屬內(nèi)存在廣泛的核質(zhì)不一致,核基因和葉綠體系統(tǒng)發(fā)育分析都支持忍冬亞屬與輪花亞屬為姊妹類群。在忍冬亞屬中,支持直管組和空枝組的單系性,而囊管組和忍冬組為多系。
根據(jù)核基因和葉綠體的系統(tǒng)關(guān)系,研究人員建議將藍(lán)葉忍冬Lonicera korolkowii歸并到空枝組,將藍(lán)果忍冬Lonicera caerulea歸并到忍冬組。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn),忍冬屬植物估計起源于漸新世中期(26.45 Ma)。忍冬組的干群年齡為17.09 Ma(95%HPD:13.30-24.45)。輪花亞屬干群年齡估計為16.35 Ma(95%HPD:14.12-23.66)。祖先分布區(qū)重建表明忍冬亞屬原產(chǎn)東亞和中亞,空枝組和忍冬組起源東亞,隨后擴(kuò)散到其他地區(qū),亞洲內(nèi)陸干旱化可能促進(jìn)該地區(qū)空枝組和忍冬組快速輻射演化。
本文的第一作者、海南大學(xué)博士生孫慶惠表示,該研究完全支持白令海峽和北大西洋陸橋關(guān)于北半球洲際遷移的假說?偟膩碚f,這一工作較好地解決了忍冬亞屬內(nèi)主要分支之間的深層系統(tǒng)關(guān)系,特別是忍冬亞屬內(nèi)目前公認(rèn)的四個組間的關(guān)系,也為忍冬亞屬的分類復(fù)雜分支和物種形成提供新見解。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107808
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