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遺傳編碼熒光RNA探針研究獲新進展
作者：李晨陽 來源：中國科學(xué)報
山東拓普生物工程有限公司  http://www.jlkcpj.cn
近日，華東理工大學(xué)藥學(xué)院、生物反應(yīng)器工程國家重點實驗室、光遺傳學(xué)與合成生物學(xué)交叉學(xué)科研究中心楊弋教授團隊在遺傳編碼熒光RNA探針研究中取得重要進展，相關(guān)研究成果發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《生物傳感器與生物電子學(xué)》。
活細胞內(nèi)的代謝物呈現(xiàn)高度的時空動態(tài)分布，它們往往需要在正確的時間和空間以正確的數(shù)量才能行使其生理功能，這為細胞內(nèi)代謝物的監(jiān)測帶來了極大挑戰(zhàn)。此前，基于熒光蛋白的遺傳編碼熒光探針已被廣泛用于活細胞內(nèi)代謝物的實時監(jiān)測,但在實際操作中有很大局限。近年來，基于熒光RNA開發(fā)的遺傳編碼熒光探針為活細胞代謝監(jiān)測帶來了新的機遇。
在本研究中，研究團隊基于此前發(fā)展的高性能熒光RNA（Pepper）發(fā)展了一系列可特異性識別不同小分子代謝物與蛋白質(zhì)的遺傳編碼熒光探針。與此前開發(fā)的熒光RNA探針相比，Pepper熒光RNA探針表現(xiàn)出諸多優(yōu)勢。首先，由于不含G-四鏈體結(jié)構(gòu)，Pepper熒光RNA探針在哺乳動物細胞中顯示出更高的折疊效率和細胞亮度。其次，與此前報道的波長最長的Red Broccoli探針（590nm）相比，Pepper熒光RNA探針的最大發(fā)射波長顯著紅移，可達620nm。最后，不同顏色的HBC染料都能用于Pepper熒光RNA探針的標記與成像，使得Pepper熒光RNA探針具有良好的適配性，能夠與不同顏色的其他成像工具進行組合使用。
上述性質(zhì)使得Pepper熒光RNA探針能夠?qū)Σ溉閯游锛毎麅?nèi)靶標分子的濃度與位置變化進行實時監(jiān)測，為生命科學(xué)基礎(chǔ)研究與疾病機理解析提供了極具價值的實用工具。
該論文第一作者為華東理工大學(xué)藥學(xué)院方夢悅博士、李慧文博士與謝鑫博士，通訊作者為楊弋教授和陳顯軍教授。該研究得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、上海市細胞代謝光遺傳學(xué)技術(shù)前沿科學(xué)研究基地、生物反應(yīng)器工程國家重點實驗室基金等經(jīng)費資助。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1016/j.bios.2023.115411
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