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全球首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組發(fā)布
[所屬分類:行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2024-5-20] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
全球首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組發(fā)布
作者:雍黎 來源:科技日?qǐng)?bào)
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jlkcpj.cn
5月19日,重慶市農(nóng)科院發(fā)布消息,該院果樹所柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發(fā)布了國際首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組。相關(guān)研究成果以學(xué)術(shù)論文近日在國際期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》發(fā)表。
楊蕾介紹,血橙是一種極具特色的甜橙品種,具有較高的花青素含量,其含有的多種成分對(duì)人體健康有益。目前,國內(nèi)血橙主要在川渝地區(qū)種植,總種植面積超過100萬畝,其中重慶有40萬余畝。然而,現(xiàn)主栽血橙品種存在品質(zhì)不穩(wěn)定等問題。
該團(tuán)隊(duì)開展自主品種選育,發(fā)掘高糖高花青素芽變新資源“內(nèi)秀”,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。由于國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量的血橙基因組,團(tuán)隊(duì)利用最新的第三代測(cè)序技術(shù),對(duì)血橙芽變資源進(jìn)行了全基因組測(cè)序,成功組裝了首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組,測(cè)序深度可達(dá)65X,基因組裝完整度評(píng)估為98.20%。團(tuán)隊(duì)結(jié)合比較基因組學(xué)分析,揭示了血橙花青素合成能力的染色體結(jié)構(gòu)變異基礎(chǔ)。
檢測(cè)分析表明,在中國西南地區(qū),“內(nèi)秀”在甜度和紅度方面都超過了當(dāng)?shù)刂髁髌贩N“塔羅科”血橙,具有強(qiáng)大的市場潛力。此項(xiàng)科技成果將有力推動(dòng)高品質(zhì)血橙功能基因研究和基因組進(jìn)化研究工作,并為后續(xù)血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。
(本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò),版權(quán)歸原作者所有,如有侵權(quán)可后臺(tái)聯(lián)系刪除。)
作者:雍黎 來源:科技日?qǐng)?bào)
山東拓普生物工程有限公司 http://www.jlkcpj.cn
5月19日,重慶市農(nóng)科院發(fā)布消息,該院果樹所柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發(fā)布了國際首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組。相關(guān)研究成果以學(xué)術(shù)論文近日在國際期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》發(fā)表。
楊蕾介紹,血橙是一種極具特色的甜橙品種,具有較高的花青素含量,其含有的多種成分對(duì)人體健康有益。目前,國內(nèi)血橙主要在川渝地區(qū)種植,總種植面積超過100萬畝,其中重慶有40萬余畝。然而,現(xiàn)主栽血橙品種存在品質(zhì)不穩(wěn)定等問題。
該團(tuán)隊(duì)開展自主品種選育,發(fā)掘高糖高花青素芽變新資源“內(nèi)秀”,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。由于國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量的血橙基因組,團(tuán)隊(duì)利用最新的第三代測(cè)序技術(shù),對(duì)血橙芽變資源進(jìn)行了全基因組測(cè)序,成功組裝了首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組,測(cè)序深度可達(dá)65X,基因組裝完整度評(píng)估為98.20%。團(tuán)隊(duì)結(jié)合比較基因組學(xué)分析,揭示了血橙花青素合成能力的染色體結(jié)構(gòu)變異基礎(chǔ)。
檢測(cè)分析表明,在中國西南地區(qū),“內(nèi)秀”在甜度和紅度方面都超過了當(dāng)?shù)刂髁髌贩N“塔羅科”血橙,具有強(qiáng)大的市場潛力。此項(xiàng)科技成果將有力推動(dòng)高品質(zhì)血橙功能基因研究和基因組進(jìn)化研究工作,并為后續(xù)血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。
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