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青島能源所開發(fā)單細(xì)胞表型篩選液滴打印平臺

[所屬分類:行業(yè)動態(tài)] [發(fā)布時間:2024-1-25] [發(fā)布人:邵玉倩] [閱讀次數(shù):] [返回]
青島能源所開發(fā)單細(xì)胞表型篩選液滴打印平臺
作者:廖洋,劉陽,王冰笛 來源:中國科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司  http://www.jlkcpj.cn
隨著基因組合成與編輯技術(shù)的迅猛發(fā)展,基于液滴的單細(xì)胞表型篩選的意義顯得尤為重要。然而,如何精準(zhǔn)、高通量地將目標(biāo)單液滴分配到特定的宏觀介質(zhì)中,進(jìn)而完成下游多組學(xué)分析,仍然是一個技術(shù)挑戰(zhàn)。
近日,中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所單細(xì)胞中心開發(fā)了一種基于液滴打印的平臺,以“單孔單液滴”方式將含有單克隆的液滴打印至培養(yǎng)皿或96孔板中,從而服務(wù)規(guī);⒌统杀、全自動的單細(xì)胞表型獲取和篩查。該成果發(fā)表于《傳感器和執(zhí)行器B:化學(xué)》。
傳統(tǒng)篩選方法,如瓊脂平板和微孔板篩選,是目前應(yīng)用最廣泛的兩種篩選策略。瓊脂平板法操作簡單,但難以準(zhǔn)確定量,主要用于菌株的初篩。微孔板篩選能精準(zhǔn)定量,便于評價突變體的性能,但通量較低。
據(jù)了解,基于液滴微流控的工具有望滿足超高通量篩選的需求,但目前大多數(shù)的分選策略只能將表型一致的液滴富集到一個通道中,難以將每個“目標(biāo)液滴”高精度、高通量、自動化地分離到宏觀介質(zhì)的特定空間位置,以開展下游單細(xì)胞培養(yǎng)、測序等實(shí)驗(yàn)。
針對這些問題,該所單細(xì)胞中心研究小組基于電流體動力學(xué)打印技術(shù),開發(fā)了一種基于液滴打印的芯片化平臺,以“單孔單液滴”方式將含有單克隆的液滴打印到指定的位置。這個平臺包括四個主要模塊:泵驅(qū)動微流控芯片模塊、光學(xué)自動信號識別模塊、高壓控制模塊和自動化的移動平臺模塊。芯片中預(yù)埋的光纖可引入紅光LED,當(dāng)分選后的目標(biāo)液滴流過檢測窗口時,光纖連接的二級管可識別并產(chǎn)生相應(yīng)信號,進(jìn)而利用電流動力學(xué)原理將液滴打印到特定區(qū)域。
據(jù)介紹,該芯片平臺特色鮮明。首先,不僅能實(shí)現(xiàn)在線生成液滴并打印,且可對孵育或分選后液滴進(jìn)行按需精確打印,打通了“目標(biāo)液滴群”到“單個目標(biāo)液滴”的高效渠道,服務(wù)下游單細(xì)胞層面表型研究。其次,增加了基于光纖傳輸?shù)墓鈱W(xué)檢測模塊,不僅提高液滴打印的準(zhǔn)確率,且規(guī)避了復(fù)雜光路系統(tǒng);這一簡潔而集成化的系統(tǒng)可兼容更多的下游實(shí)驗(yàn)場景,如質(zhì)譜檢測、培養(yǎng)皿、96孔板等。
下一步,研究人員將基于前期開發(fā)的FlowRACS和RACS-Seq/Culture等單細(xì)胞拉曼分選儀器系列,耦合上述高精度按需單液滴打印模塊,針對微生物組、大規(guī)模突變體文庫等復(fù)雜生命系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)全流程高精度、高通量、自動化的功能單細(xì)胞識別、分離、培養(yǎng)和導(dǎo)出,服務(wù)于生物資源、合成生物技術(shù)、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、深海/深地/深空探索、生物安全等產(chǎn)業(yè)。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.snb.2024.135334
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